ペプチドもアミノ酸が集まったものですが、その数がちがいます。たんぱく質はアミノ酸が数十万から数百万集まってできていますが、ペプチドはアミノ酸が数個集まった状態のことをいいます。また、個々のアミノ酸の生理機能についての研究も盛んにおこなわれ、今後の個々のアミノ酸の生理機能を利用した有用な薬の開発に大きな期待が集まっています。医療の世界でも活躍手術に欠かせないアミノ酸アミノ酸輸液の開発がはじまった当初は、たんぱく質を成分として動物実験が行われていました。生体の蛋白質はほとんどの場合、Rで表記した側鎖の違いによる20種類のアミノ酸からなる。個々のアミノ酸はこの側鎖の性質によって、親水性・疎水性、塩基性・酸性などの性質が異なる。アンモニアは毒性が強いので肝臓で無害な尿素にして尿として排泄されます。排泄作用のおもな担い手はアルギニンです。
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